ну, генетику еще никто не отменял :)
Упрощенно - есть мама и папа, у мамы и папы есть свои родители, и так далее. в процессе скрещивания получаются разные окрасы, но тем не менее, родители наследуют признаки не только своего окраса, но и других, которые были у предков.
есть специальные калькуляторы, которые помогают посчитать возможные варианты окрасов котят от конкретной пары родителей еще до их рождения.

можно и вручную считать, но это долго :)